A un anno di distanza da System 1, Apple rilascia System 2 che si fa subito notare per le prestazioni del Finder aumentate di oltre il 20%. I comandi Put Back e Close All vengono pensionati, mentre fanno la loro comparsa New Folder e Shutdown. I dischi possono essere espulsi trascinandone semplicemente l'icona sul cestino, ma resta comunque la possibilità di utilizzare il comando Eject Disk. Viene aggiunta la visualizzazione, non gerarchica, ad albero delle directory e dei relativi files. Sul desktop compare l'accessorio Choose Printer per la gestione/selezione delle stampanti che successivamente si evolverà in Chooser.

La minor update 2.1 aggiunge il supporto agli Hard Disk con dimensioni fino a 20 Mb.